بالمقارنة مع المركبات التقليدية ، تتمتع المركبات التي تعمل بخلايا الوقود بالمزايا التالية

1. انبعاثات صفرية أو انبعاثات قريبة من الصفر.

2. تقليل تلوث المياه الناتج عن تسرب الزيت.

3. تقليل انبعاثات غازات الاحتباس الحراري.

4. تحسين الاقتصاد في استهلاك الوقود.

5. تحسين كفاءة الاحتراق للمحرك.

6. عملية سلسة ولا ضوضاء.